2023年，东京。东山总理（仲村亨饰）在世界环境会议上，高调地表明了“COMS”的进一步推进。接着，官房长官长沼周也（杉本哲太饰）宣布，东山将以“未来的日本”为目标，召集各省厅优秀的年轻官员，成立“日本未来推进会议”。环境省的天海启示（小栗旬饰）、经产省的常盘纮一（松山研一饰）也入选了。某天，网络上刊登了一篇田所雄介（香川照之饰）的报道，他敲响了关东沉没的警钟。因为这篇报道，一部分团体发起了示威，天海为了平息事态与田所见面。但是，田所对天海的话充耳不闻，并发出了预言，不久后伊豆海域会有一座岛沉没。抱着一丝

地球物理学家田所雄介博士带领自己的团队前往深海科考，却发现海底出现异常龟裂与乱泥流，在一系列调查之后，他得出来日本列岛在一年后即将沉没的结论。可是日本政府的官员们却认为田所博士的预测只不值得相信的谎言。只有山本首相认识到事态的严重性，并且委任田所的前妻鹰森沙织为危机管理大臣，带领田所博士和他们的团队设法拯救日本…